包装风格和之前Z97 GAMING 9 AC相似。带封面的开窗展示设计的礼盒式。
作为GAMING系列中的头牌，附件也毫不含糊，2个双路SLI连接器、6根SATA 6Gb/s线、一套eSATA PCI位转接口配件、一块黑底红字印刷带缓冲垫的挡板、一个声卡独立供电转接线、一套测量线、一组用于面板接线的集线器、两个无线网卡使用的天线和一张GAMING的LOGO贴纸。此外还有一个无线模块（装在主板上了），采用Intel AC7260，支持 Wi-Fi 802.11 a/b/g/n/ac，2.4GHz/5GHz波段和蓝牙4.0。
此外还有一套全黑的线材标签贴、一个GAMING图案的门把挂牌、一张主板布局彩页、一张GAMING系列宣传页、使用手册和软件使用手册各一本、驱动盘两张。
经历了Intel 7/8/9系三代芯片组，MSI GAMING的这个红龙LOGO和红黑配色也攒了一定的知名度。外形上的风格延续到了这次的X99上。由于平台复杂度和X79类似，这次的X99多数也都采用了26.9cm宽（比标准ATX宽大约1英寸）的板型（属于E-ATX的范围），X99S GAMING 9 AC也是如此。
和之前的数款Z97一样，不少特性的LOGO都印在了背面。
又见这种风骚的标注方式。和E-ATX在X79/X99上出镜率高的的理由类似，平台特性决定了X99主板基本都是8层PCB起。
由于处理器和芯片组都没有集成显卡，主板上自然就不见视频输出接口。从左至右依次是键鼠通用的PS/2×1、USB2.0×2|Clear CMOS按钮|USB3.0×2|USB3.0×2|USB3.0×2|LAN×1、 USB3.0×2|WiFi+BlueTooth模块|音频接口×5、S/PDIF光纤输出。其中能表现出MSI GAMING这个系列独有特色的点包括被统一做成红色和黑色的接口颜色、PS/2和USB2.0接口采用“游戏接口（据称包括更厚的镀金层与支持USB 1000Hz刷新率）”设计、网卡下方两个USB接口采用了名为“USB Audio Power”的稳压设计、音频接口采用了镀金设计。
这个背部接口处的屏蔽罩（同时还一直延伸到声卡部分）在之前的Z97 GAMING 9 AC上已经见识过了。刻有GAMING 9的字样。剧透下类似设计在这次很多X99主板上都能找到。
延伸到集成声卡的部分。和Z97 GAMING 9 AC不同的是留了个天窗给带灯光的Codec屏蔽罩一个展示的机会。
两段式的供电MOSFET散热器，以镀镍热管相连。照顾到靠近CPU供电的部分，而靠近背部接口的部分仅仅是增加散热面积的作用，并没有照顾下方的元件。造型上和Z97的那批类似，只是原本伸出的红色的龙爪。收了回去。
芯片组的散热也采用了大尺寸散热片。同时也装饰了盾型的LOGO。开机后同样有灯光效果。
正面最后一抹红则是位于PCI位扩展槽区域处的这个“Stream Engine”，稍后介绍。
主板上两个散热器背面，可以看清楚真实照顾的区域。
扒完散热片后就显得乌漆墨黑的了。在这块主板上依然可以看到使用了亚光黑色外观的PCB、料件方面和之前一样依然是名为“第四代军规用料”的组合（黑色的固态电容，印有SFC字样的电感和CPU供电部分的钽电容），可惜风扇位只有5个（两个CPU，三个机箱）。
CPU插座为Socket LGA 2011-V3。和X79上使用的2011在外形上类似，但是互不兼容，而扣具包括预留的散热器背板和螺丝孔位，双边杠杆设计，当然扣具黑化这种提升卖相的做法当然也少不了。目前支持的CPU包括代号为Haswell-E的处理器。
8相CPU外部供电设计。和Haswell一样，Haswell-E本身也配置了FVIR调压模块。因此主板上的供电部分不用像过去那般花太多心思。输入接口为CPU 8pin+4pin组合。
每相“两上两下”MOSFET设计。每两相由一颗带倍相的驱动器驱动。
其中一部分的MOSFET置于主板的背面。
和X79一样的双倍内存插槽设计，注意两边内存的卡槽方向，不要装错。8条均为DDR4 DIMM。依照CPU和芯片组的特性以及主板的优化程度，支持最大128GB，DDR4-2133（标称支持超频3333MHz）的non-ECC、Unbuffered内存，支持四通道设计和XMP功能。因此和X79一样，内存数量建议使用4条或者8条。卡扣使用了单边式方便安装显卡后的对内存的插拔。
扩展槽方面的配置为①PCIe 3.0 x16|②空| ③PCIe 3.0 x16（最大x8）|④PCIe 2.0 x16（最大x4） |⑤PCIe 3.0 x16|⑥空|⑦PCIe 3.0 x16（最大x8）。卡扣为按下弹起式。
由于PCIe 3.0均由Haswell-E CPU提供，而这一代Haswell CPU拥有40条PCIe通道和28条PCIe通道两种规格，搭配不同CPU时支持的模式各有不同。详细分配方式引用说明手册上的表格。可以看到主板上的M.2接口既有依靠CPU上的PCIe 3.0 x4模式，亦有依靠芯片组的PCIe 2.0 x2且与SATAe共享的模式。其中PCI_E1/2/3/4/5分别对应上文中①③④⑤⑦。
位于②位置附近，原本被一抹红色盖住的，其实是一个mini PCIe接口的插槽，上面预装了一个AverMedia C353(DarkCrystal HD Capture)视频采集卡。由于游戏视频的录制需求越来越广泛，作为主打游戏体验的GAMING系列抓住了这一个机会提供了这样的方案。
M.2 M键接口。可支持CPU上PCIe 3.0 x4(32Gb/s)模式或PCH上PCIe 2.0 x2/SATA(10Gb/s)模式。支持42/60/80mm长度规格的模块。
存储接口方面包括8个SATA 6Gb/s和1个SATAe 10Gb/s。均来自X99芯片组原生。相比X79只有2个SATA 6Gb/s而言可谓重大提升。其中编号SATA1~6的6个接口支持RAID0/1/5/10和Intel SRT，而SATAe接口兼容的两个SATA(SATA7~8)与SATA9~10并不支持RAID，这也是芯片组本身的特性。
X99芯片组的真身。
在内存槽与24pin电源输入口附件布置了复位键、开关键、以及一键超频用的OC Genie。旁边的小开关为OC_SWITCH，选择OC Genie键的超频幅度。OC Genie键启用时会发出蓝色光，而开关键则在主板上电后就会发出绿色。OC_SWITCH开关则有蓝、红双色指示低和高。下面还有一组带底座的电压测量点。
前置USB3.0接线座，支持两个USB3.0，X99原生，这组USB3.0支持MSI Super Charger快速充电功能。此外在主板靠近角落的地方还有一组X99原生的USB3.0接线座。
两位的侦错指示器。具体定义可以参考说明书。MSI的这个指示器在正常开机并正常进入系统后则会显示CPU温度一栏的数值。
双BIOS与双BIOS切换开关。配有蓝色和绿色的LED指示当前为BIOS1和2。
Slow Mode开关，在极限超频时提高成功率使用。必须等待开机后出现BIOS POST画面时切换到开启状态。在关机时切换到开启状态则会无法启动。
Super I/O芯片为熟悉的Nuvoton NCT6792D+。
音频部分并没有采用Z97 GAMING 9 AC上那套二度强化用料并引入双声卡的方案，而是和Z97 GAMING 7类似的普通Audio Boost 2的方案。采用Realtek ALC 1150 7.1 HD Audio Codec、带红色发光的屏蔽罩和PCB隔离带、Nichicon SW系列电容、双OPA1652运放以及Creative Sound Cinema 2音效驱动、支持电源独立供电。
网卡自然是招牌的Qualcomm Atheros Killer E2205，配合驱动自带的Killer Network Manager可以进行应用对使用网络带宽和优先级的设置，优化使用体验。
背部的8个USB3.0中，其中两个来自ASMedia ASM1042A。
还有四个来自VIA VL805。
